
เรื่องราวเริ่มต้นเมื่อ Scooby-Doo และ Shaggy ขับรถไปเยือน Metropolis ซึ่งเป็นเมืองที่เต็มไปด้วยความลึกลับและภัยคุกคาม ทีม Mystery Inc. พบกับ Krypto ซึ่งเป็นสุนัขที่มีพลังพิเศษที่ได้รับมอบหมายให้ปกป้องเมืองนี้จากเหล่าวายร้ายและภัยคุกคามต่างๆ พวกเขาต้องร่วมมือกันเพื่อไขปริศนาของการหายตัวไปของเจ้าของ Krypto, Superman, และจัดการกับอาชญากรที่มีแผนการร้ายที่เกี่ยวข้องกับทั้งโลกมนุษย์และโลกของซูเปอร์ฮีโร่
การผจญภัยที่เต็มไปด้วยการลุ้นระทึก, ความตลกขบขัน, และการผสมผสานพลังพิเศษของ Krypto กับความฉลาดของทีม Scooby-Doo จะทำให้ผู้ชมได้สัมผัสความสนุกจากการร่วมมือกันของทั้งสองโลก